Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KNCNA6PVL3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms