Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms