Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCE3A1L190 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms