Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP16Q9Y5T5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms