Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms