Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR1DQ9Y2S0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms