Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBNO2Q9Y2G9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SBNO2Q9Y2G9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms