Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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USP18Q9UMW8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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USP18Q9UMW8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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USP18Q9UMW8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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USP18Q9UMW8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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