Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGXB4Q9UGU5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms