Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms