Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MED17Q9NVC6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms