Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT84Q9NSB2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms