Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A4GALTQ9NPC4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms