Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms