Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PECRQ9BY49 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms