Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TEFMQ96QE5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms