Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGBD1Q96JS3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms