Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms