Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms