Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RGP1Q92546 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms