Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE22Q8NFJ8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE22Q8NFJ8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms