Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC24Q8N4L8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC24Q8N4L8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC24Q8N4L8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC24Q8N4L8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC24Q8N4L8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC24Q8N4L8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC24Q8N4L8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC24Q8N4L8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC24Q8N4L8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC24Q8N4L8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC24Q8N4L8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC24Q8N4L8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC24Q8N4L8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms