Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPAP2Q8IXW5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms