Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM5Q71RC9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms