Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms