Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms