Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q5VSD8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q5VSD8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q5VSD8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q5VSD8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q5VSD8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q5VSD8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q5VSD8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q5VSD8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q5VSD8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q5VSD8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms