Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NHSL1Q5SYE7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHSL1Q5SYE7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms