Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms