Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms