Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC93Q567U6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms