Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSD17B12Q53GQ0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms