Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C4orf17Q53FE4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms