Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms