Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF4Q2M2E3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms