Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC27Q2M243 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms