Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RTN1Q16799 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTN1Q16799 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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