Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRF1Q16656 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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