Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PCM1Q15154 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PCM1Q15154 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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PCM1Q15154 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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PCM1Q15154 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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