Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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