Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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COL19A1Q14993 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL19A1Q14993 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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COL19A1Q14993 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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