Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF9Q13886 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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