Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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