Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RIGQ13278 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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