Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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