Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE4BQ07343 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms