Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFDNP55196 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms