Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLTPP55058 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLTPP55058 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLTPP55058 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLTPP55058 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms