Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUCLG1P53597 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms