Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms